食品厂消毒机是食品加工必需设备，为保证食品安全，主要是用于加工车间与加工设备的消毒灭菌，空间的消毒灭菌，物品的表面消毒灭菌，水的消毒灭菌，食品设备、容器、工具、生产过程的消毒灭。
食品厂消毒机主要应用：
空间杀菌消毒应用
速冻食品、冷饮食品、肉蛋奶制品加工车间与包装车间利用臭氧消毒效果好，同时可去除异味污染。
对于中央空调净化系统以外的洁净区，或需要灭菌的其他房间则需单独进行灭菌处理。方法是先用臭氧发生器，直接安装在该房间内。根据需要设定消毒时间，消毒结束便自动关机，所以使用非常方便。按房间空间体积的大小选型使用。只要满足臭氧浓度的要求，就可以达到消毒灭菌的目的。比用化学试剂对房间的熏蒸要省事得多，可*代替化学熏蒸，缩短消毒时间，避免二次污染。
物品的表面消毒灭菌
在食品生产过程中，常常要对原材料、工具器材、包装物、生产场所等进行物体表面消毒。传统的方法是用紫外线消毒，但消毒不*，存在消毒死角，衰减快，对于特定环境中的某些细菌无法杀死等种种弊端。
水的消毒灭菌
在食品厂用水的地方较多，有原料用水，清洗用水及饮用水等区别。据不同的水质要求，采用不同的工艺流程，消毒工艺则用一般的臭氧水处理方法即可达到满意的效果。
食品设备、容器、工具消毒杀菌
在饮料，果汁等生产过程中，臭氧水可用于管路、生产设备及盛装容器的浸泡和冲洗，从而达到消毒灭菌的目的。采用这种浸泡、冲洗的操作方法，一是管路、设备及盛装容器表面上的细菌、病毒大量被冲淋掉；二是残留在表面上的未被冲走的细菌、病毒被臭氧杀死，非常简单省事，而且在生产中不会产生死角，还*避免了生产中使用化学消毒剂带来的化学毒害物质排放及残留等问题。另外，利用臭氧水对生产设备的消毒灭菌技术结合膜分离工艺、无菌灌装系统等，在酿造工业中用于酱油、醋及酒类的生产，可提高产品的质量和档次。
在蔬菜加工中的应用，如小包装蔬菜如传统的榨菜、萝卜、小黄瓜等食品加工中，很多企业为延长产品的保质期，往往采用包装后高温杀菌的工艺，这样不仅对产品的色泽、质地等带来了不利的影响，而且还消耗了大量的能源。利用臭氧水冷杀菌新技术可避免传统加工工艺对产品质量带来的不利影响，并且可提高产品质量，降低生产成本。
在水产制品加工中的应用，在冷冻水产品的冻前处理中，通过臭氧水喷淋杀菌对水制产品的卫生指标可以起到很好的控制作用。
在冷库中的应用
一是杀灭微生物——消毒杀菌；二是使各种有臭味的无机物或有机物氧化—-除臭；三是使新陈代谢产物氧化，从而抑制新陈代谢过程。
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